元朝设行省——明州复名“庆元路”
元代中央行政机构名称是中书省，中央行政机构在地方设置的派出机构，就叫行省。行省制度最早起源于魏晋南北朝时期，元朝打天下时，打下一个地区就设一个“行中书省”，相当于临时军事管理机构。设多了，设久了，元朝政府干脆让它正式成为凌驾于州之上的大行政区。至今700多年，行省制度已经成了中国十分稳定的政区制度。行省之下，基本沿袭宋制，依次分为路(府)、州、县。宋朝的“庆元府”(宁波)复格为“庆元路”，属“江浙行中书省”，省治设在杭州。舟山、余姚、奉化都由县升格成州，分别为昌国州、余姚州、奉化州。
明清袭省制——宁波减辖至5县
明清时期，省仍为最高地方行政区划，但称谓权限却迭经变化。明太祖朱元璋为削减省府州县地方势力的权力，废除“行中书省”，改称“承宣布政使司”，简称“布政司”，并且三权分立，设布政司管民政，按察司管司法，都指挥使司管军事，简称“布司”、“按司”、“都司”。布、按、都三使皆为封疆大吏，互不统属。这和元代的行省制度已有区别，但因为“布政司”区划和前代相同，所以习惯还是称“行省”或“省”。1368年，方国珍降朱元璋后，明太祖朱元璋改“庆元路”为“明州府”，隶属“浙江行中书省”，浙江省名始此。昌国、余姚、奉化也复为县。除余姚属绍兴府外，昌国(舟山)、奉化、鄞、慈溪、象山、定海(镇海)6县仍属“明州府”。1381年，为避国号讳，朱元璋采纳鄞县读书人单仲友的建议，取“海定则波宁”之义，将明州改称宁波府。宁波之名沿用至今。
清代在明制基础上，恢复行省称谓，长官为总督、巡抚。总督可以管辖两省至三省，巡抚为一省的最高军政长官。在省和府(州、厅)之间增设台道，带兵备衔，管辖府州，名义上算是省的派出行政机构。浙江省设宁绍台道，治绍兴，宁波府为其所辖。随着宁波经济的飞速发展，1658年，宁绍台道迁治宁波。1687年，清政府认为“舟山”称谓有舟动而不静之嫌改名其为“定海山”，在昌国县旧境重设“定海县”，原“定海县”让名为“镇海县”，这一让就是几百年，至今仍如此。1841年，鸦片战争爆发，舟山战略地位越发重要，清廷升“定海县”为定海直隶厅，属宁绍台道。宁波府辖县由此减为5个。
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